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2015年—2016年度南宁部分地区猪戊型肝炎病毒基因型分析
作者: 贺微 姚静 覃一峰 林思远 邹柳 黄加滨 韦莹 欧阳康 陈樱 黄伟坚 韦祖樟 广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室 广西南宁530005
关键词: 戊型肝炎病毒 基因型 猪
摘要：为了解广西猪群中戊型肝炎病毒（HEV）基因型,利用套式RT-PCR用对南宁周边猪场采集到的104份新鲜猪粪便进行HEV检测、分离并成功扩增和克隆了11株阳性毒株的ORF2基因部分保守片段。序列测定结果表明,11株HEV ORF2序列自身核苷酸同源性为97.7%-100%,推导编码的氨基酸同源性为97.9%-100%;与4型HEV代表毒株Ch-S-1、Ch-T11、swGX40等的核苷酸同源性为84.6%-90.6%,而与其他各型之间的同源性较低。系统发育进化树结果表明,11株HEV广西株为基因4型,其中,10株HEV为4a亚型,1株毒株为4e亚型。结果表明,广西猪群中流行的HEV均为基因4型,且以4a亚型为优势流行毒株。
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