陕西省部分地区猪圆环病毒2型全基因组的遗传变异分析

摘要：为了解陕西省猪圆环病毒2型（PCV2）的遗传变异情况,根据GenBank登录的PCV2全基因组序列,设计1对引物,从陕西省部分地区规模化猪场疑似PCV2感染的病猪采集病料9份,应用PCR扩增PCV2的全基因,其中6份为阳性,并对扩增的6个PCV2全基因组序列进行测序和序列分析。基因测序表明,PCV2基因组全长为1 767bp;对6株病毒序列进行同源性比较,6个毒株全基因之间核苷酸同源性为98.3%-100%,与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组比较,同源性为96.3%-97.8%;与近几年陕西株比较发现基因变异程度不稳定,与2013年分离株（KX352154.1）同源性最高,2015年分离株（KX352159.1）次之,反而与2014年分离株（KX068219.1）最低;对6个毒株的ORF1和ORF2基因进行同源性比较,6个毒株的ORF1和ORF2基因的核苷酸同源性分别为98.1%-100%和98.2%-100%,与GenBank上已发表的国内外参考株ORF1和ORF2基因进行同源性比较,同源性分别为97.6%-99.8%和91.5-96.0%。陕西省流行的PCV2基因组较为保守,变异不大,同源性很高。