鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析

摘要：为研究鹅细小病毒（GPV）基因遗传变异特征，采集海南某养鹅场疑似鹅细小病毒感染的病料，将其处理后接种番鸭胚成功分离到一株病毒，经PCR鉴定为鹅细小病毒，命名为HN株，并获得了其全基因组序列，将该序列与GenBank数据库中登录的16条鹅和番鸭细小病毒基因序列进行了比对分析。结果显示，该株病毒基因组全长为5106bp，由ITR、NS、VP构成，其中ITR为444bp，NS1为1844bp，VP1为2199bp；HN株与SHFX1201株的NS1基因和VP1同源性最高，分别达到99．8％和99．7％，与番鸭细小病毒株FM的NS1基因同源性最低，为82．7％；与90-0215株VP1同源性最低，为80．1％。HN株的遗传进化树可以看出，GPV可以分成明显的2个基因亚群，HN株与鹅细小病毒匈牙利株（B）、欧洲疫苗株（VG32／1）和台湾株（82—0321V、82—0321、06—0329）均处在第1亚群，且与安徽分离株Y株以及SHFXl201株同源性最接近，番鸭源匈牙利株FM单独处于第Ⅱ亚群。本研究丰富了GPV的数据资料，为研究GPV分类地位以及遗传进化关系提供了依据，同时也为研究GPV流行趋势和疫苗的开发奠定了基础。