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广西鸭源H6N6亚型禽流感病毒HA和NA基因的序列分析
作者: 莫胜兰 [1] ; 郑敏 [1] ; 陈义祥 [1] ; 胡杰 [1] ; 屈素洁 [1] ; 梁媛 [1] ; 粟艳琼 [1,2] ; 陆文俊 [1] ; 苏凯 [1] ; 陈玉华 [1] ; 李军 [1] ; 刘棋 [1,2]
关键词: 禽流感病毒 鸭 H6N6亚型 血凝素 神经氨酸酶 序列分析
摘要:为了明确H6亚型禽流感病毒在广西地区的流行情况,广西自治区动物疫病预防控制中心从健康家鸭体内分离鉴定了一株H6N6亚型禽流感病毒A/duck/GX/038/2009(H6N6)(Dk/GX/038/09),对其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进行了克隆和序列分析,并绘制了基因遗传进化树。结果显示,Dk/GX/038/09的HA和NA基因核苷酸与2005年广东鸭源H6N6亚型禽流感病毒的同源性最高,达97%;但其NA基因核苷酸与江苏2009年鸭源H6N6毒株同源性则较低,只有88.6%;Dk/GX/038/09与2005年从广东分离的多株鸭源H6N6禽流感病毒位于同一分支,具有较近的亲缘关系,而与2009年江苏分离H6N6鸭源禽流感病毒的亲缘关系相对较远。表明两广地区流行的H6N6毒株可能来自同一祖先病毒,这也许与两广地区禽类交易频繁相关;而与江苏H6N6毒株相应基因差异较大,表明当前我国流行的鸭源H6N6毒株存在一定的地域差异和明显的遗传多样性。
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