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三株鸡源H4亚型禽流感病毒分离株HA基因的序列分析
作者: 张鹏 [1,2] ; 黄娟 [1] ; 陈杰 [2] ; 蒋文明 [2] ; 陈继明 [2] ; 单虎 [1]
关键词: 禽流感病毒 H4亚型 序列分析
摘要:RT-PCR扩增出3株鸡源H4亚型禽流感病毒(AIV)分离株(A/chicken/Anhui/AB22/2010;A/chicken/Anhui/AB29/2010;A/chicken/Anhui/AB30/2010)的血凝素(HA)基因,进行了分子克隆与测序,对测得的HA序列用DNAStar软件分析,并同NCBI资源库里已有的序列用MEGA5软件进行比较分析其遗传变异。结果显示,3株分离株与湖南分离株A/duck/Hunan/819/2009(H4N2)关系很近,同源性达98.4%以上。裂解位点的氨基酸序列均为PEKASRG,符合低致病性AIV的序列特征。全球谱系分析表明,这些分离株属东半球谱系的欧亚分支。本研究在国内首次报道了鸡源H4亚型禽流感病毒血凝素全基因序列,该结果对我国禽流感研究有一定参考价值。
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