2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析

摘要：为了研究2012年-2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行毒株的分子生物学特性和变异规律，对分离自闽西多个地区25份疑似PRRS病料的10个PRRSV分离株，应用RT—PCR对其中ORF5基因进行扩增及序列分析，从而了解闽西地区PRRSV的遗传变异性。结果表明，10个毒株均为美洲型PRRSV，9株PRRSVORF5基因全长为603bp（FJ05为600bp），10个毒株ORF5基因之间的核苷酸同源性为88．4％～99．3％；与VR-2332、MLV和CH-1a毒株的核苷酸同源性为88．3％～98．8％，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．9％～99．0％，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为63．8％～65．09／6。ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9—40位和58—62位，10株PRRSVoRF5氨基酸同源性为88．5％～99．5％；与VR-2332、MLV和CH-1a的氨基酸同源性为87．5％～98．5％，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．0％～99．5％，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为56．6％～59．2％。遗传进化树表明，闽西地区PRRSV可以分为疫苗株（1株，10％）、中等毒力PRRSV（1株，10％）和HP—PRRSV（8株，809／6）3个亚群，其中以HP—PRRSV为主，表明闽西地区PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性。