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猪丹毒杆菌SpaA基因的生物信息学分析
作者: 卢琴 ; 李明波 ; 彭先文 ; 宋忠旭 ; 雷彬 ; 梅书棋
关键词: 猪丹毒 PCR检测 SpaA 生物信息学分析
摘要:旨在对猪丹毒杆菌的SpaA基因进行PCR检测,并对该基因所编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR检测,后将SpaA基因的保守区域进行生物信息学分析。结果表明,PCR扩增得到了与猪丹毒杆菌SpaA基因大小一致的1 531bp片段,二级结构的预测结果显示,该蛋白主要以螺旋、无规则卷曲为主,只有少数的伸展链。推测该蛋白有4个B细胞抗原表位区域。该研究为猪场猪丹毒杆菌病的检测提供了试验数据,也为阐明猪丹毒杆菌病的免疫机理和制备表位疫苗等奠定理论基础。
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