一株H1N1亚型猪流感病毒全基因克隆及遗传特性分析

作者: 孟慧芝 [1,2] ; 孙涛 [1] ; 岳志芹 [1] ; 王文斌 [2]

关键词: 猪流感病毒 H1N1 全基因组测序特异位点分析

摘要：为快速获知流感病毒的全基因组序列,及时得知其遗传演化特性。设计11对通用条形码引物,采用RT-PCR法扩增A／swine／Shandong／01／2009（H1N1）株的8个基因节段,进行克隆测序和遗传进化分析。核酸序列测定结果显示,全基因组序列完整无缺失,但是基因组内2个位点突变导致PB1-F2、NS-1蛋白表达不完整,HA切割位点处氨基酸序列PSIQSR/GLF,无多个连续的碱性氨基酸,符合非致病性切割位点的特征。从绘制的各个片段进化树分析,此毒株与11株近5年在人和猪中流行的H1N1相似度高,HA的同源性达98.1%~99.7%,NA同源性98.6%~99.8%,与2009年暴发的A型H1N1流行株A/California/07/2009（H1N1）8个片段进行比对,核酸同源性高达99.1%~99.6%。

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一株H1N1亚型猪流感病毒全基因克隆及遗传特性分析

作者: 孟慧芝 [1,2] ; 孙涛 [1] ; 岳志芹 [1] ; 王文斌 [2]

关键词: 猪流感病毒 H1N1 全基因组测序 特异位点分析

关键词: 猪流感病毒 H1N1 全基因组测序特异位点分析