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2010年-2011年我国五省PRRSV分离株ORF5基因遗传变异分析
作者: 刘沫飞 [1] ; 李蕾 [1] ; 郑辉 [2] ; 李岚 [3] ; 王赛赛 [4] ; 吴发兴 [2] ; 李晓成 [2] ; 王洪斌 [1] ; 黄保续 [2]
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 病毒分离 遗传变异
摘要:为了解2010年-2011年间我国5省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRsV)流行毒株的分子生物学特性及变异规律,应用Mcar-145细胞分离得到15株PRRSV,通过RT—PCR方法对15株PRRSV的ORF5基因进行扩增和序列分析。依据NCBI所下载的标准序列设计一对引物,对ORF5全长进行扩增(603bp),分离株之间的核苷酸同源性为98.8%~99.9%,核苷酸推导的氨基酸同源性为95.59/6~99.5%。15株PRRSV分离株与美洲型的PRRSV同源性较高,可推断均属美洲型。其中9株ORF5(151)氨基酸位点发生与HB-1相同的变异,即R151-K151,其余6株ORF5(151)氨基酸位点与JAX1相同,即ORF5(151)为R。系统进化树表明,BFLN3—2010、BFSDe1—2011和BFAH2-20113株与CH-1a在同一分支,属于第2亚群,BFLN2~2010等12株与JAX1在同一分支,属于第4亚群。
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