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南阳黄牛TLR2基因扩增及序列分析
作者: 周峰 [1] ; 薛云 [2] ; 龙塔 [1] ; 赵战勤 [1] ; 马蓓蓓 [1]
关键词: 南阳黄牛 Toll样受体2 序列分析
摘要:根据GenBank中发表的牛TLR2基因序列设计引物,通过PCR方法对南阳黄牛的TI。R2基因进行分段扩增并测序,拼接后得到包含TLR2完整编码区以及5’端和3’端非编码区的2399bp的全序列。序列分析结果表明,南阳黄牛TLR2基因开放阅读框全长2355bp,共编码784个氨基酸。南阳黄牛的TLR2基因编码区与荷斯坦牛的相比发生了16个碱基突变,其中9个发生在胞外区,2个发生在跨膜区,5个发生在胞内区,没有引起氨基酸的改变。与GenBank已发表的其他动物TLR2基因参考序列进行比较,结果显示南阳黄牛与荷斯坦牛、野牛、水牛、山羊、绵羊、猪、大猩猩和人的同源性分别为99.3%、99.3%、98.0%、96.3%、95.5%、85.4%、83.2%和83.1%。TLR2N末端存在信号肽且可能在21位氨基酸处存在裂解位点,蛋白分子结构预测TLR2蛋白含1个跨膜结构域。