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传染性法氏囊病病毒四川分离株VP2基因序列分析
作者: 严专强 [1] ; 刘迪 [1] ; 刘佳佳 [1] ; 覃健萍 [2] ; 鲁俊鹏 [2] ; 谢青梅 [1] ; 毕英佐 [1] ; 陈峰 [1]
关键词: 传染性法氏囊病病毒 VP2基因高变区 克隆 序列分析
摘要:为了解四川地区传染性法氏囊病病毒(IBDV)的变异规律,本研究对20儿年分离自四川的10个毒株进行了VP2基因高变区的克隆与测序。序列分析表明,10个分离株之间核苷酸序列同源性在95.3%~99.9%之间,其推导氨基酸序列同源性在99.2%~100%之间;所有分离株与国内外IBDV超强毒株(HK46、OKYM、UK661)的核苷酸同源性在94.4%~98.5%之间,其推导氨基酸序列同源性在98.6%~100%之间。遗传进化分析表明,分离株与超强毒株属同一分支,亲缘关系较近,并且与超强毒株VP2高变区内的特征性氨基酸相符合,据此推测四川省目前流行的毒株仍以超强毒株为主。本研究分离株与常用疫苗株的亲缘关系较远,一定程度上反映了当前四川省IBDV流行毒株与疫苗毒株之间的进化距离。