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一株鸭源H3N6亚型禽流感病毒遗传进化分析
作者: 曹蓝 [1,2] ; 焦培荣 [1,2] ; 宋亚芬 [1,2] ; 龚浪 [1,2] ; 袁润余 [1,2] ; 韦良孟 [1,2] ; 亓文宝 [1,2] ; 廖明 [1,2]
关键词: 禽流感病毒 H3N6 基因组序列分析 分子遗传演化
摘要：从活禽交易市场健康鸭体内分离到一株H3N6亚型禽流感病毒,命名为A/Duck/Guangdong/E9/2012（H3N6）,这是该亚型禽流感病毒在我国广东地区的首次分离报道。为分析其遗传进化特征,对该病毒全基因组序列进行了测定,进行了遗传进化分析。结果显示,其HA裂解位点附近的氨基酸序列为PE-KQTR↓GLF,只含有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的HA裂解位点氨基酸序列的分子特征;其HA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7457/2011（H3N5）禽流感病毒的HA基因同源性最高,其NA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7438/2011（H4N6）禽流感病毒的NA基因同源性最高。全基因组分子遗传进化分析结果显示,其8个基因均属于欧亚谱系的禽源进化分支。