两株野鸭源新城疫病毒分离株F基因和HN基因的分子特性分析

作者: 徐钰 [1] ; 解林红 [1] ; 耿海东 [1] ; 高晓龙 [2] ; 王海军 [3] ; 范胜涛 [3] ; 李元果 [4] ; 王铁成 [4] ; 吴长江 [1] ; 张晓田 [1] ; 孙贺廷 [1] ; 初冬 [1] ; 高玉伟 [4]

关键词: 新城疫病毒 F基因 HN基因

摘要：为了分析从湖南长沙分离到的野鸭源新城疫病毒（NDV）融合蛋白基因（F基因）和血凝素-神经氨酸酶基因（HN基因）分子特性,采用RT-PCR方法对分离自野鸭粪便的2株NDV的F基因和HN基因进行了扩增和遗传进化分析。F基因序列分析表明,编码区核苷酸为1 662bp,编码553个氨基酸,F基因碱性裂解位点序列为^112E-R-Q-E-R-L^117,符合NDV弱毒特征,与ClassⅠ类NDV代表毒株核苷酸同源性在92.3%-93.8%之间。HN基因序列分析表明,编码区核苷酸为1 851bp,编码616个氨基酸,与ClassⅠ类NDV代表毒株核苷酸同源性在91.6%-93.9%之间。根据F基因和HN基因遗传进化分析表明,此次分离到的2株NDV同属于ClassⅠ类Genotype 3型。

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