羊口疮病毒凤翔株ORFV121和vIL-10基因的生物信息学分析

作者: 刘方 ; 赵玄多 ; 安贝 ; 刘慧 ; 高洋 ; 张立强 ; 贾芸晓 ; 陈德坤

关键词: 羊口疮病毒凤翔株 ORFV121 vIL-10 基因差异

摘要：为分析羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因在凤翔（FX0910）强毒株（vORFV）和弱毒株（lvORFV）之间的差异,应用PCR方法扩增羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因的全长序列并测序,应用生物信息学软件分析基因的核酸、氨基酸相似性,蛋白的亲水性、二级结构以及抗原性。结果显示,lvORFV的ORFV121基因118位的谷氨酸缺失,说明该处发生的碱基突变为有意突变,该突变导致弱毒株相应蛋白的亲水性、二级结构发生变化,蛋白的抗原性在很多区域发生本质改变；vIL-10在蛋白质水平出现了5个氨基酸位点突变（14：V→W,49：A→P,57：T→M,72：R→C,102：I→V）和79位插入1个色氨酸。这些位点差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生了变化。ORFV121基因和vIL-10基因在vORFV和lvORFV之间存在差异,这些基因差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生改变。

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