猪圆环病毒2型重组病毒分离株的鉴定

摘要：为了解某猪场猪圆环病毒2型（PCV-2）的流行及毒株基因组变异情况，应用 PCR 方法从6个疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征（PMWS）病死猪的心脏、淋巴结、脾脏和肺脏等病料中进行猪圆环2型病毒的检测，并对阳性病料进行 PCV-2全基因组的扩增，将成功扩增到的6株 PCV-2全基因组克隆到 pMD-18T Simple Vector，构建重组质粒。对全基因组进行测序，然后对全基因组进行同源性、遗传进化、重组以及毒力分析。结果表明，6株 PCV-2基因组长度均为1767 bp，与参考序列的同源性在88．1％～99．6％之间，并且 LNF3、HEBF5和 HEN65为 PCV-2b1C 基因型，LN51为 PCV-2b1B 基因型，HEN60株为 PCV-2b1A 基因型，HEBF7属于 PCV-2a，但不属于任何亚型，可能为 PCV-2a 向 PCV-2b 的过渡株。利用重组分析软件RDP4．25和 SIMPLOT3．5．1分析，表明 LN51株可能来自 PCV-2a2A 和 PCV-2b1A 基因型的重组。根据PCV-2 Cap 的76位和131位氨基酸残基，有5株符合强毒特征（76I、131T），而 HEBF7株存在强、弱毒的特征。本研究为我国 PCV-2流行株的分子特征研究提供了参考。