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一株金黄色葡萄球菌小菌落突变株全基因组测序分析
作者: 王奇惠 时永强 祝宇 张赛飞 朱立力 曲伟杰 云南农业大学动物科学技术学院 云南昆明650201
关键词: 金葡菌小菌落突变株 基因序列差异 全基因组测序 单核苷酸多态性
摘要:对金黄色葡萄球菌小菌落突变株(small colony mutant strains Staphylococcus aureus, SASCVs)和CP000253.1基因组差异进行了研究,为后续研究金葡菌分泌抗药物相关物质能力提供数据支持。对一株金葡菌小菌落突变株进行全基因组测序,并与CP000253.1参考序列进行序列比较。结果显示,金葡菌SCVs的文库插入片段为350bp,测序读长为150bp,SCVs的原始数据量为551Mb,SCVs的碱基含量分布在处理前后有所不同,通过重测序,存在单核苷酸多态性(SNP)的数量较大。金葡菌SCVs与CP000253.1参考序列之间存在明显的序列差异,该数据为研究金葡菌感染奶牛乳房炎提供了一定的序列依据。
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