福建省羊传染性脓疱病毒FIL、B2L和VIR基因的遗传变异分析

摘要：为探明2014年-2015年在福建省流行的羊传染性脓疱病毒（ORFV）遗传变异情况，对10株oRFV流行毒株的F1L、B2L和VIR基因进行克隆、测序及分析。结果表明，10株ORFVF1L基因之间的核苷酸序列同源性为97．6％～100％，与国内株的核苷酸序列同源性为96．8％～99．79／6，与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96．3％～97．1％；同NZ2参考株比较，FJ-YT2014缺失2个氨基酸；10株ORFVB2L基因之间核苷酸序列同源性为97．59／5～99．9％，与国内株的核苷酸序列同源性为96．7％～99．5%，与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96．7％～97．7％；10株ORFVVIR基因之间的核苷酸序列同源性为95．8％～99．5％，与国内株的核苷酸序列同源性为94．6％～99．6％，与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为94．6％～96．4％。基于基因核苷酸序列的遗传进化分析表明，10株ORFVF1L基因与福建省分离株、山西株和新疆株亲缘关系较近；10株oRFVB2L基因与新疆、山西、德国毒株亲缘关系较近；10株ORFVVIR‘基因与台湾、新疆株亲缘关系较近。结果提示，当前福建省流行的ORFVF1L、B2L和VIR基因尚未出现明显变异，但是其F1L、B2L和VIR基因核苷酸序列之间普遍存在异质性。