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鸡冷诱导RNA结合蛋白基因序列分析及组织表达
作者: 叶青华 [1] ; 吴巧 [2] ; 岳华 [2] ; 储倩 [2]
关键词: 鸡 冷诱导RNA结合蛋白 生物信息学分析 组织定量分布
摘要：为研究鸡冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）基因的结构特征和组织定量分布情况，根据GenBank中原鸡CIRP基因（NM-001031347）的编码区序列自行设计引物，从健康雏鸡脾脏中扩增青脚麻羽鸡CIRP基因的编码区（CDS）并进行生物信息学分析；设计引物建立实时荧光定量RT—PCR，检测CIRPmRNA在雏鸡各组织器官中的分布及相对表达水平。结果显示，鸡CIRP基因CDs区全长573bp，编码190个氨基酸，其氨基端包含一个RNA结合域，羧基端富含RGG重复序列，推导的多肽链羧基端比鸭、班胸草雀及哺乳动物要多18个氨基酸；CIRP基因在鸡各被检组织器官中均有表达，相对表达水平由低到高分别为法氏囊、肺脏、胰腺、胸腺、脾脏、睾丸、盲肠扁桃体、心脏、脑、肾脏、哈德氏腺、肝脏。本研究为进一步探讨鸡CIRP基因的遗传进化及其在病原感染中的作用提供了参考。