藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测

作者: 张晓芬 ; 冶贵生 ; 文熙萍 ; 祁秀清

关键词: 藏羊 IFN-γ基因反转录-聚合酶链反应序列分析蛋白结构预测

摘要：为了研究藏羊IFN-γ基因的功能,提取藏羊脾脏总RNA,通过RT-PCR扩增藏羊IFN-γ基因并测序,应用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。结果表明,藏羊IFN-γ基因长度为429bp,其中腺嘌呤和胸腺嘧啶含量较高,该基因编码143个氨基酸,其中疏水性氨基酸和亲水性氨基酸的含量较高。藏羊IFN-γ基因与参考绵羊、山羊、藏羚羊和牛IFN-γ基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.1%和97.2%,氨基酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.3%和95.8%。IFN-γ蛋白主要由α螺旋组成,亲水性较高,含有5种蛋白质功能位点,分别为1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酰胺化位点、2个N-糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点和3个蛋白激酶C磷酸化位点。

上一篇：鸡细小病毒与禽呼肠病毒二重PCR检测方法的建立
下一篇：基于DNA-launched的猪繁殖与呼吸综合征病毒反向遗传操作系统的建立

藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测

作者: 张晓芬 ; 冶贵生 ; 文熙萍 ; 祁秀清

关键词: 藏羊 IFN-γ基因 反转录-聚合酶链反应 序列分析 蛋白结构预测

关键词: 藏羊 IFN-γ基因反转录-聚合酶链反应序列分析蛋白结构预测