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FPLV、CPV、MEV非结构蛋白NS1和结构蛋白VP2遗传特征分析
作者: 杨莘 [1] ; 王建科 [1] ; 易立 [1] ; 许红丽 [1] ; 程世鹏 [1] ; 武华 [1]
关键词: 猫泛白细胞减少症病毒 犬细小病毒 水貂肠炎病毒 NS1基因 VP2基因
摘要:为了解猫泛白细胞减少症病毒(FPLV)、犬细小病毒(CPV)、水貂肠炎病毒(MEV)氨基酸遗传演化规律,探索细小病毒在不同种属动物间跨种传播过程中病毒蛋白氨基酸差异特点以及毒株流行病学特征。通过搜集确定为CPV、MEV的粪便病料,PCR扩增克隆非结构蛋白NS1和结构蛋白VP2基因,并参考GenBank中其他细小病毒毒株,对其推导的氨基酸序列构建遗传发育树,进行病毒的遗传进化分析,同时对细小病毒流行毒株的非结构蛋白NS1和结构蛋白VP2基因编码的氨基酸差异位点进行了归纳总结。遗传进化分析结果表明,细小病毒不同种属以及同种属各亚型之间NSl蛋白氨基酸同源性高于VP2蛋白,但氨基酸差异较小。FPLV和MEVNS1和VP2蛋白原本保守的氨基酸,在遗传进化的过程中出现与CPV一致的突变(NS1蛋白第247、350、545、595位氨基酸;VP2蛋白第101、232、411位氨基酸)。FPLV、MEVVP2蛋白氨基酸在进化过程中不同于CPV,但是更加稳定。我国CPV分离毒株中,CPV-2a亚型VP2蛋白Ile324位氨基酸独特位点仍然存在。