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柔嫩艾美耳球虫棒状体颈部蛋白EtRON2基因的克隆及序列分析
作者: 戚南山 [1] ; 孙铭飞 [1] ; 廖中权 [1] ; 吴彩艳 [1] ; 吕敏娜 [1] ; 袁建丰 [1] ; 余劲术 [1] ; 蔡建平 [1] ; 李祥瑞 [2]
关键词: 柔嫩艾美耳球虫 棒状体颈部蛋白2 基因克隆
摘要:预测并克隆柔嫩艾美耳球虫棒状体颈部蛋白2(EtRON2)基因,分析其结构特点及与顶复门其他虫属间的差异。本研究利用生物信息学和比较基因组学技术注释拼接得到柔嫩艾美耳球虫(Eimeriatenella)棒状体颈部蛋白2(EtRON2)的基因序列,用RT-PCR方法扩增出Etron2全长ORF;以E.tenella子孢子的基因组DNA为模板,用PCR方法成功扩增出Etron20RF片段的gDNA序列片段。生物信息学分析结果显示,Etron20RF片段的gDNA含有11个内含子,0RF全长为4020bp,编码一段全长为1339个氨基酸的多肽片段,与其他物种RON2的氨基酸序列相似性为15%-41%;Etron2基因在顶复门原虫中相对保守,与犬新孢子虫及弓形虫相似性最高,亲缘关系最近,Etron2的成功克隆填补了柔嫩艾美耳球虫在此方面研究的空白,为进一步研究其功能打下了基础。
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