- · 【植保学院】多措并举保障留校学生过温馨年[02/18]
- · 【资环学院】举办留校学子新春趣味运动会[02/16]
- · 【信息学院】制作专属微信红包封面[02/13]
- · 【创新学院】新春送祝福温暖学子心[02/12]
- · 【资环学院】新春慰问暖人心 浓浓关爱显真情[02/12]
- · 【学生处】因为有你们才“最美”[02/10]
- · 【园林学院】《中国新疆之历史印记》纪录片引发师生关注[02/08]
- · 【农学院】整合资源引企入教 扎实推进人才培养[02/08]
2.1c亚群猪瘟病毒GXF29/2013株全基因组克隆测序及遗传进化分析
作者: 黄耀华 [1,2] ; 邵卫星 [2] ; 杨雨辉 [1] ; 董雅琴 [2] ; 刘爽 [2] ; 吴发兴 [2] ; 张志 [2] ; 李晓成 [2]
关键词: 猪瘟病毒 全基因组 序列分析 2 1c亚群
摘要:参考GenBank 登录的2.1 亚群猪瘟病毒(CSFV)的核苷酸序列,设计并合成4 对引物,应用RTPCR 技术,扩增出了CSFV 广西流行毒株GXF29/2013的全基因组,并进行核苷酸测序.结果GXF29/2013株的全基因组长度为12296个核苷酸.用MEGA5.0软件对GXF29/2013与GenBank上登录的20株不同亚型(1.1、2.1、2.2、2.3和3.4)CSFV 参考株进行全基因组核苷酸序列及开放阅读框编码的氨基酸序列比较,发现GXF29/2013 与参考株核苷酸序列同源性在83.2% ~98.0% 之间,氨基酸序列同源性在91.2%~98.8%之间.用E2基因进行系统发生树分析,结果表明GXF29/2013属于最近出现的2.1c亚群.对E2蛋白进行分析,结果表明GXF29/2013株有2.1c亚群毒株的特征,与2.1b毒株的遗传进化关系比与1.1亚群毒株的近.该毒株既保留了CSFV E2蛋白的一些关键特征,又与疫苗毒株的一些关键抗原位点不同.GXF29/2013病毒株全基因序列的获得为下一步进行CSFV 反向遗传操作平台的建立奠定了基础.