环洞庭湖地区活禽市场鸭源NDV的分离鉴定及遗传演化分析

摘要：从洞庭湖地区周边县市几个活禽市场的健康家鸭中分离到14株具有血凝性的病毒,通过血凝、血凝抑制试验及RT-PCR鉴定,其中1株为新城疫病毒,命名为Duck/hunan/yy858/14。通过对该病毒的F基因全长扩增,并转化、克隆、测序及构建F基因的遗传进化树,推导其核苷酸序列。序列测定及遗传进化分析显示,该毒株F基因全长为1 792bp,ORF为1 662bp,可编码553个氨基酸,其氨基酸裂解位点的组成为112 ERQERL117,具有典型新城疫病毒弱毒的分子特征,与我国内地首次分离到的Class I毒株NDV08-004、吉林野鸟毒株J36/13、香港活禽市场分离株Chicken/HongKong/1525.16/2005在同一分支,属Class I类基因3型。同源性分析显示该毒株与ClassⅡ中弱毒疫苗株V4和La Sota的核苷酸及氨基酸的同源性均较低,分别为73.4%和71.6%;与香港活禽市场分离株Chicken/HongKong/1525.16/2005和首例内地分离到的鸭源新城疫病毒毒株Duck/China/08-004/2008的核苷酸同源性分别为91.2%、91.0%;与吉林野鸟毒株J36/13的核苷酸同源性最高为98.3%,推测与野鸟毒株有共同来源。