鸡腺胃型传染性支气管炎病毒山东分离株S基因的克隆及序列分析

摘要：为研究3株鸡腺胃型传染性支气管炎病毒（IBV）山东分离株（青岛腺胃株QX株、东营腺胃株DY株、肥城腺胃株FC株）病毒纤突蛋白基因（S基因）的核苷酸特征,与呼吸型M41标准株及肾型IBV进行S基因核苷酸进行同源性比较。采用RT-PCR技术方法,对IBV分离株（QX、DY、FC）及标准毒株M41株S基因进行克隆和序列测定,对其中QX和DY株S基因核苷酸分别用3种方法（Clustal V method、Jotun Hein method和Clustal W method）对获得的基因核苷酸序列进行分析。结果显示,QX株和DY株的S基因核苷酸与标准毒株M41株S基因核苷酸的同源性最高为79.3%和79.2%,最小差异性为24.5%和22.3%。QX株和DY株与肾型IB分离株HD同源性最高为78.4%和78.9%,最小差异性均为22.7%。HD株与M41株的同源性最高达到80.8%。通过对S基因进化关系分析,说明腺胃型IBV山东分离株（QX、DY株）与呼吸型和肾型IBV是引起不同组织嗜性的IBV变异株,与呼吸型IBV和肾型IBV有明显的差异,是在IBV遗传变异进化过程中具有重要地位的进化阶段。