马传染性贫血病毒强毒株gag和gp45基因的体内进化分析

摘要：摘要：为研究马传染性贫血病毒（EIAV）强毒株体内进化规律，将3匹马分别以1×10^5TCID50／匹接种EIAVLN40强毒株后，在不同时间点采取外周血，分离单核白细胞。提取白细胞中的DNA，并以其为模板，应用套式PCR技术分别扩增EIAV前病毒DNA的p15，p9和gp45基因，经克隆后进行序列分析。结果显示，与接种前EIAVLN4。相比较，p15基因核苷酸和氨基酸平均差异率分别为1．8％（0-2．9％）和1．7％（0-3．6％）；p9分别为2．5％（0．3％-3．8％）和2．9％（0-4．8％）；gp45-工分别为1．3％（0．3％-2．1％）和1.8％（0-3．2％），gp45-11分别为2．1％（0-3．4％）和2．6％（0-4．7％）。在EIA发热期，每个基因核苷酸和氨基酸差异率最小；在亚临床阶段，每个基因平均差异率总体上相对较高。氨基酸变异位点分析发现，发病期（2-2、3-1）各基因氨基酸序列回复到亲本株EIAVLN40，其余时期p15基因氨基酸稳定变异位点16N／S、88T／S和112M／E；p9基因115E／G和122K／M；gp45-I基因9T／F／L；gp45-Ⅱ基因21E／K和29G／S。此外，p15基因进化树结果显示，发热期（2-2、3-1）p15基因序列与EIAV。N蚰序列处于同一分支上，亚临床阶段大多数p15基因序列处于另一个大分支上；其他基因进化情况与p15基因类似。对EIAVp15、p9、gp45基因体内进化分析，有助于对EIAV在马体内感染进程的研究，为进一步研究EIAV持续感染和逃避免疫监视的机制提供参考。