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一株鸡新城疫病毒陕西分离株F基因的遗传进化分析
作者: 韩春元 ; 王利勤 ; 张三东
关键词: 新城疫病毒 分离鉴定 F基因 序列分析 遗传进化 鸡
摘要：从陕西省某大型养鸡场的疑似新城疫病鸡群中分离到1株新城疫病毒。对该新城疫病毒陕西分离株进行F基因的扩增、序列测定和遗传进化分析。结果显示，该新城疫病毒分离株的 F基因全长为1662 bp ，F蛋白裂解位点区的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117，具备强毒株的特征；同源性分析表明，该新城疫病毒瘾分离株与国内外流行的基因Ⅶ型强毒株之间的同源性较高，在92．4％～98．0％之间，其中与国内流行的基因Ⅶd亚型毒株的同源性最高，达97．3％以上，而与现用疫苗毒株LaSota（DQl95265）、F48E9（AY508514）、B1（AF309418）、V4（AF217084）、Mukteswar（EF201805）等的同源性较低，在83．2％～86．0％之间；系统进化树分析表明，该新城疫病毒分离株与2个国内流行的基因Ⅶ d亚型参考株 FJ882014和FJ608335处在同一个进化分支上，亲缘关系最近。