猪繁殖与呼吸综合征病毒GX1003株全基因序列测定与分析

摘要：为了解广西省猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的遗传变异情况，采用RT—PCR对PRRSV广西地方分离株GXl003株全基因组进行分段扩增、测序与分析。结果表明，不包括Poly（A）尾，Gx1003株基因组全长为15320nt。同源性分析表明，GXl003株与比对的国内外PRRSV美洲型毒株全基因核苷酸及其推导氨基酸序列的同源性分别为85．0％～99．4％和82．1％～99．1％，与欧洲型代表株LV株的同源性分别为60．6％和51．39／6。序列分析表明，GXl003株的NSP2编码区存在第48l位aa和第533～561aa发生30个氨基酸的不连续缺失，具有高致病性PRRSV（HP—PRRSV）的遗传特征；同时，在不同编码区出现与HP—PRRSV代表株JxAl株不同的遗传变异现象。遗传进化分析表明，比对的所有美洲型毒株可以分为4个亚群，Gx1003株分布在以JxAl株为代表的亚群4中。表明PRRSV广西地方分离株Gx1003株属于HP—PRRSV，但其基因组在不同区域发生了新的遗传变异。