猪繁殖与呼吸综合征病毒 TJM 株5′和3′非翻译区克隆与测序

作者: 刘莹 [1] ; 王凤雪 [1] ; 温永俊 [1] ; 武华 [2]

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 5′非翻译区 3′非翻译区 cDNA末端快速扩增

摘要：为了获得猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）TJM 株5′非翻译区（5′UTR）和3′非翻译区（3′UTR）的准确序列，采用 cDNA 末端快速扩增（RACE）技术进行克隆测序。结果表明，5′和3′末端快速扩增技术（5′RACE 和3′RACE ）能很好地扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒的末端序列，分别获得长度为493 bp和750 bp 的片段。与 NCBI 中已发表的原野毒株 TJ 株序列（EU860248．1）及其他毒株比对分析发现，TJM株5′UTR 较 TJ 株有4处突变，突变后与 XJu-1株序列完全一致，其中，前3处突变与许多亚洲毒株相同，3′UTR 序列没有改变。通过预测 RNA 二级结构发现，TJM 株5′UTR 核苷酸序列的改变能够影响 RNA 二级结构，而该二级结构是病毒复制和拯救的关键。TJM 株5′和3′末端序列的获得，为病毒基因组功能结构分析和全长感染性克隆的构建奠定了基础。

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