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鸽新城疫病毒北京分离株F基因的遗传进化分析
作者: 王林 ; 韦海涛 ; 宋彦军 ; 周德刚 ; 梅力 ; 李刚 ; 雷琪莉 ; 冯小宇
关键词: 鸽源新城疫病毒 F基因 北京分离株 序列分析
摘要:对一株分离自北京市的鸽源新城疫病毒BJP13株的F基因进行扩增、序列测定和分析。结果显示,F基因核苷酸序列长为1 662bp,编码553个氨基酸,蛋白裂解位点的序列为112RRQKRF117,具备强毒株的序列特征;同源性比较显示,BJP13与国内外不同基因型毒株的同源性在87.9%-99.1%;与新城疫基因Ⅵ型的同源性较高,为93.7%-99.1%,其中与基因Ⅵb亚型中的毒株11和毒株LLN713同源性最高为99.1%,与1996年北京分离株STP96的同源性最低为93.7%;与基因Ⅰ型疫苗株V4株和基因Ⅱ型疫苗株La Sota株的同源性分别为90.3%和88.6%;遗传进化分析显示,北京分离株BJP13与比利时毒株11、4940和中国毒株SDS、LLN713最为接近,位于同一进化分支上,属于基因Ⅵb亚型。
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