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腹泻羔羊与健康羔羊肠道微生物群落分析
作者: 罗海霞 [1] 杨易 [1] 谢秀兰 [2]
关键词: 滩寒杂交羊 羔羊 肠道微生物 腹泻
摘要:羔羊腹泻与其肠道菌群的种类及比例密切关系.为了探索肠道菌群结构在腹泻病程的变化,采集同样饲养条件下20份1月龄~3月龄滩寒杂交羊粪便样本,通过Miseq测序技术并结合多变量统计学方法检测细菌16 S rRNA基因V4-V5区的多样性,通过数据分析,比较了腹泻羊粪便与正常羊粪便中微生物的类别及数量.从门的水平分析,腹泻羔羊肠道中变形菌门显著高于健康羔羊.发现拟杆菌门、蓝细菌门、黏胶球形菌门和无壁细菌门在腹泻羔羊中的含量显著低于健康羔羊.从科水平分析2个样本优势菌具有显著差异,其中腹泻羔羊肠道放线菌乳杆菌科显著高于健康羔羊,而瘤胃球菌科显著低于健康羔羊.非优势菌也存在显著差异,如拟杆菌科、柔膜菌科和理研菌科.比较了滩寒杂交羊健康羔羊及腹泻羔羊肠道微生物的差异,发现其微生物丰度及优势微生物都具有显著的差异,因此,腹泻羔羊中的肠道微生物差异可能是羔羊腹泻的重要因素之一,研究结果为羔羊腹泻的研究及治疗提供了理论依据.
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