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冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析
作者: 仇保丰 宋鸿雁 董蓉莲 高雪梅 蒋荧梅 顾炳泉 胡顺林 扬州大学江苏省动物预防医学重点实验室 江苏扬州225009 南通出入境检验检疫局 江苏南通226004 南通大学实验动物中心 江苏南通226001 江苏省疾病预防控制中心 江苏南京210009
关键词: 冷冻原肠 解冻池 细菌多样性 16SrDNA文库
摘要:为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16SrDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分析发现,除去24.00%~32.00%为无法鉴定的未培养细菌和未分类细菌以外,其余细菌来自于芽胞杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲和黄杆菌纲,分别占各文库克隆总数的38.00%~42.00%、20.00%~26.00%、4.00%~8.00%和0~2.00%。除去44株无法鉴定的细菌,进一步对其他106株细菌进行分析发现,其中2株放线菌目细菌和5株肠杆菌科细菌无法进一步鉴定,其余99个菌株包含了来自19个属的至少30种细菌,且肠球菌属、变形杆菌属和芽胞杆菌属为其中的优势菌属。本研究显示冷冻原肠浸泡解冻池水中细菌多样性较高,其中部分细菌为致病菌和条件致病菌。