2014年-2016年广西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2和ORF5基因的遗传多样性分析

摘要：为了解广西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行毒株的遗传进化情况，对2014年-2016年来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行Nsp2和ORF5基因的扩增和测序分析。结果获得34个Nsp2基因序列和45个ORF5基因序列，均属于美洲型毒株。Nsp2基因间核苷酸序列的同源性为91．89／6～100％，与PRRSV美洲型毒株VR-2332、CH—1a、JXA1及NADC30株核苷酸序列的同源性分别为81．3％～84．3％、88．9％～92．1％、94．3％～99．3％和73．5％～75．1％，而与PRRSV欧洲型毒株LV株核苷酸序列的同源性为51．5％～53．2％。ORF5基因间核苷酸序列的同源性为82．8％～100％，与PRRSV美洲型毒株VR-2332、CH-1a、JXA1及NADC30株核苷酸序列的同源性分别为83．7％～99．5％、85％～95％、83．8％～99．7％和83．2％～86．4％，而与PRRSV欧洲型毒株LV株核苷酸序列的同源性为62．4％～64．5％。基于Nsp2和ORF5基因推导的氨基酸序列绘制的遗传进化树中，广西地区的毒株主要分布在以JXA1为代表的Ⅳ亚群。表明当前广西PRRSV流行毒株以JXA1株为代表的高致病性美洲型毒株为主，各毒株Nsp2和ORF5基因序列存在一定的差异，尚未发现欧洲型毒株和美洲型NADC30类毒株。