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2株H3N8亚型禽流感病毒HA和NA基因遗传变异分析
作者: 屈素洁 [1] ; 郑敏 [1] ; 梁媛 [1] ; 莫胜兰 [1] ; 陆文俊 [1] ; 粟艳琼 [1] ; 胡杰 [1] ; 李军 [1] ; 刘棋 [1]
关键词: 禽流感病毒 HA基因 NA基因 序列分析
摘要:采用RT-PCR技术扩增了2株H3N8亚型流感毒株A/duck/Guangxi/69/2009和A/chicken/Guangxi/2117/2010的HA和NA基因,并与GenBank中收录的其他毒株序列进行比较分析和遗传进化分析。结果表明,分离株的HA与NA基因全长分别为1 733 bp、1 432 bp。A/duck/Guangxi/69/2009株的HA基因与A/duck/Siberia/100/01株的相似性最高,A/chicken/Guangxi/2117/2010株的HA基因与A/white munia/HongKong/4519/00株的相似性最高;而A/duck/Guangxi/69/2009株的NA基因与A/duck/Eastern China/91/09株的相似性最高,A/chicken/Guangxi/2117/2010株的NA基因与A/aquaticbird/Korea/KN-1/04株的相似性最高。2株H3N8禽流感病毒位于同一分支,同源关系较近。2株H3N8禽流感病毒的HA推导的氨基酸剪切位点序列均为P-E-K-Q-T-R,为典型低致病性禽流感病毒的特征序列。
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