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犬瘟热病毒贵州分离株H基因的克隆及其序列分析
作者: 周莉 [1] ; 刘志杰 [1] ; 曾智勇 [1] ; 汤德元 [1] ; 李谦 [1] ; 王彬 [1] ; 张晓杰 [1] ; 甘振磊 [1] ; 王凤 [1]
关键词: 犬瘟热病毒 H基因 克隆 序列分析
摘要：根据GenBank中犬瘟热病毒Onderstepoort株序列设计特异性引物,以犬瘟热病毒贵州分离株（CDV-GZ1）RNA为模板,应用RT-PCR对病毒H蛋白编码基因进行了扩增、克隆及序列分析。测序结果表明,CDV-GZ1 H基因ORF由1 824 bp组成,可编码607个氨基酸;与已发表23株其它CDV H基因核苷酸序列相似性在91.1%~99.6%之间,推导氨基酸序列同源性在91.0%~99.2%之间。GZ1株H蛋白含有5个潜在的N-联糖基化位点,与其他毒株相比,N-联糖基化位点的数目与位置均存在差异。系统进化树分析表明,CDV-GZ1株与德国Snyder Hill株和国内广州分离株（GZ0802）具有较高的同源性,推测这些毒株间可能具有更近的亲缘关系。