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  《动物医学进展》原名《国外兽医学—畜禽疾病》,是中华人民共和国教育部主管西北农林科技大学主办的专业性学术期刊,1980年创刊,主要刊载动物医学领 ...

广西巴马小型猪内源性反转录B亚型病毒5′非编码区的序列扩增及分析

作者: 欧阳康 [1,2] ; 吴健敏 [1] ; 陈凤莲 [1] ; 马玲 [1] ; 刘文娟 [1] ; 白安斌 [1] ; 郭亚芬 [2]

关键词: 猪内源性反转录病毒 广西巴马小型猪 RACE 5′UTR

摘要:应用SMART RACE方法快速扩增广西巴马小型猪内源性反转录病毒(PERV)5′非编码区,获得了一条长度为1 423 bp的PERV-5′UTR序列(GenBank登录号GU390231),该序列与GenBank已发表的PERV-A、B、C各亚型同源性分别为92.4%~95.2%、91.8%~99.5%和86.5%~92.6%,遗传进化树分析,扩增序列为B亚型PERV-5′UTR。一级结构分析表明,该序列由U3、R、U5、PBS和LEADER 5个区域构成,与GenBank已发表的其他序列相比缺少344 bp。通过plantCARE数据库鉴定,GU390231序列得到28个有效的顺式作用元件,推测这些元件对PERV的转录起着或正或负的调控作用。本试验获得的PERV-B亚型5′UTR序列对进一步研究广西巴马小型猪PERV-B亚型病毒的转录调控机制奠定了基础。


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