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西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析
作者: 邹勇 [1] ; 吴飞 [1] ; 郭雅旭 [1] ; 耿晓蕊 [1] ; 张文慧 [1] ; 王玉霞 [1] ; 李希来 [2] ; 林青 [1,2]
关键词: 猪蛔虫 核糖体DNA 转录间隔区 序列测定 遗传变异
摘要:为了摸清西北部分地区猪蛔虫内转录间隔区(ITS)的遗传变异特点,扩增了猪蛔虫ITS基因,进行测序,依据GenBank公布的ITS序列将测序结果截为ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比对各段序列的差异性。结果显示,所有样品ITS序列长约1 000bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的长度分别为450bp~453bp、159bp、272bp,种内差异分别为0~0.2%、0、0。基于ITS1的种系发育分析表明,23个猪蛔虫样品均位于同一分支,而与贝蛔属蛔虫分属两个不同分支。ITS1序列不能作为区分西北不同地区猪蛔虫的种内分子标记,但可以作为区分蛔属蛔虫与贝蛔属蛔虫的种间分子标记,研究结果为猪蛔虫的鉴定和分子流行病学调查提供了基础资料。